MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. AL-21 chromosome

Total Repeats: 46466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015216	AGA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957760
2	NC_015216	GA	4	8	96	103	50 %	0 %	50 %	0 %	325957760
3	NC_015216	A	6	6	128	133	100 %	0 %	0 %	0 %	325957760
4	NC_015216	ACCA	2	8	271	278	50 %	0 %	0 %	50 %	325957760
5	NC_015216	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957760
6	NC_015216	GTAC	2	8	336	343	25 %	25 %	25 %	25 %	325957760
7	NC_015216	CAT	2	6	366	371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957760
8	NC_015216	TG	3	6	480	485	0 %	50 %	50 %	0 %	325957760
9	NC_015216	GAA	2	6	491	496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957760
10	NC_015216	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957760
11	NC_015216	CAA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957760
12	NC_015216	TGA	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957760
13	NC_015216	GAA	2	6	592	597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957760
14	NC_015216	ACT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957760
15	NC_015216	GCC	2	6	640	645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957760
16	NC_015216	AGGA	2	8	653	660	50 %	0 %	50 %	0 %	325957760
17	NC_015216	CCAG	2	8	716	723	25 %	0 %	25 %	50 %	325957760
18	NC_015216	AAC	2	6	970	975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957760
19	NC_015216	CTC	2	6	1005	1010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957760
20	NC_015216	ATT	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957760
21	NC_015216	CATG	2	8	1037	1044	25 %	25 %	25 %	25 %	325957760
22	NC_015216	AGGAA	2	10	1177	1186	60 %	0 %	40 %	0 %	325957760
23	NC_015216	AAAC	2	8	1192	1199	75 %	0 %	0 %	25 %	325957760
24	NC_015216	AT	3	6	1727	1732	50 %	50 %	0 %	0 %	325957761
25	NC_015216	ATA	2	6	1748	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957761
26	NC_015216	ATG	2	6	1844	1849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
27	NC_015216	TAG	2	6	1878	1883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
28	NC_015216	CAAC	2	8	1894	1901	50 %	0 %	0 %	50 %	325957761
29	NC_015216	TGA	2	6	1983	1988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
30	NC_015216	TGG	2	6	1999	2004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957761
31	NC_015216	CTT	2	6	2014	2019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957761
32	NC_015216	ATG	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
33	NC_015216	GCA	2	6	2066	2071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957761
34	NC_015216	AGC	2	6	2080	2085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957761
35	NC_015216	TTG	2	6	2123	2128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957761
36	NC_015216	GAT	2	6	2131	2136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
37	NC_015216	TGG	2	6	2233	2238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957761
38	NC_015216	TGAAC	2	10	2242	2251	40 %	20 %	20 %	20 %	325957761
39	NC_015216	TGT	2	6	2296	2301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957761
40	NC_015216	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957761
41	NC_015216	ATT	2	6	2357	2362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957761
42	NC_015216	GTT	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957761
43	NC_015216	ACA	2	6	2435	2440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957761
44	NC_015216	TAAT	2	8	2613	2620	50 %	50 %	0 %	0 %	325957762
45	NC_015216	ATA	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957762
46	NC_015216	GGA	2	6	2690	2695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325957762
47	NC_015216	AAAAT	2	10	2757	2766	80 %	20 %	0 %	0 %	325957762
48	NC_015216	A	6	6	2827	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	325957762
49	NC_015216	AT	3	6	2934	2939	50 %	50 %	0 %	0 %	325957762
50	NC_015216	ATG	2	6	2952	2957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957762
51	NC_015216	GTT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957762
52	NC_015216	TAATT	2	10	3000	3009	40 %	60 %	0 %	0 %	325957762
53	NC_015216	TC	3	6	3073	3078	0 %	50 %	0 %	50 %	325957763
54	NC_015216	ATT	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957763
55	NC_015216	TG	3	6	3193	3198	0 %	50 %	50 %	0 %	325957763
56	NC_015216	AGA	2	6	3259	3264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957763
57	NC_015216	TAGG	2	8	3339	3346	25 %	25 %	50 %	0 %	325957763
58	NC_015216	TAA	2	6	3351	3356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957763
59	NC_015216	CAC	2	6	3420	3425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957763
60	NC_015216	T	7	7	3467	3473	0 %	100 %	0 %	0 %	325957763
61	NC_015216	TTG	2	6	3501	3506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957764
62	NC_015216	TTC	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957764
63	NC_015216	TTA	2	6	3564	3569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957764
64	NC_015216	GAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957764
65	NC_015216	CCA	2	6	3584	3589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957764
66	NC_015216	TAT	2	6	3601	3606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957764
67	NC_015216	TCC	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957764
68	NC_015216	GTT	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957764
69	NC_015216	ACT	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957765
70	NC_015216	TTA	2	6	3997	4002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
71	NC_015216	TAT	2	6	4010	4015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
72	NC_015216	TCC	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957765
73	NC_015216	ATT	2	6	4029	4034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
74	NC_015216	CAA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957765
75	NC_015216	AATA	2	8	4061	4068	75 %	25 %	0 %	0 %	325957765
76	NC_015216	TGC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957765
77	NC_015216	TAT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
78	NC_015216	AAG	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957765
79	NC_015216	AAAG	2	8	4137	4144	75 %	0 %	25 %	0 %	325957765
80	NC_015216	CCA	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957765
81	NC_015216	ATT	2	6	4296	4301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
82	NC_015216	ATTA	2	8	4537	4544	50 %	50 %	0 %	0 %	325957766
83	NC_015216	AATT	2	8	4551	4558	50 %	50 %	0 %	0 %	325957766
84	NC_015216	TCC	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957766
85	NC_015216	AACC	2	8	4583	4590	50 %	0 %	0 %	50 %	325957766
86	NC_015216	AAC	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957766
87	NC_015216	AT	3	6	4620	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	325957766
88	NC_015216	CTG	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957766
89	NC_015216	AAT	2	6	4759	4764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957766
90	NC_015216	CCAT	2	8	4765	4772	25 %	25 %	0 %	50 %	325957766
91	NC_015216	TTA	2	6	4787	4792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957766
92	NC_015216	ATTCCC	2	12	4813	4824	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325957766
93	NC_015216	CAA	2	6	4857	4862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957766
94	NC_015216	AACCA	2	10	4914	4923	60 %	0 %	0 %	40 %	325957766
95	NC_015216	A	6	6	5150	5155	100 %	0 %	0 %	0 %	325957767
96	NC_015216	TGC	2	6	5156	5161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957767
97	NC_015216	TAA	2	6	5167	5172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957767
98	NC_015216	A	6	6	5171	5176	100 %	0 %	0 %	0 %	325957767
99	NC_015216	ATT	2	6	5184	5189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957767
100	NC_015216	GAA	2	6	5250	5255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
101	NC_015216	AGA	2	6	5318	5323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
102	NC_015216	C	6	6	5335	5340	0 %	0 %	0 %	100 %	325957767
103	NC_015216	A	7	7	5376	5382	100 %	0 %	0 %	0 %	325957767
104	NC_015216	AAC	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957767
105	NC_015216	AGG	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325957767
106	NC_015216	A	7	7	5609	5615	100 %	0 %	0 %	0 %	325957767
107	NC_015216	GTG	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957767
108	NC_015216	AGG	2	6	5666	5671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325957767
109	NC_015216	GAA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
110	NC_015216	GAA	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
111	NC_015216	CTG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957767
112	NC_015216	GAT	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957767
113	NC_015216	CATT	2	8	5902	5909	25 %	50 %	0 %	25 %	325957767
114	NC_015216	TCA	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957767
115	NC_015216	AGT	2	6	6065	6070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957767
116	NC_015216	AGC	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957767
117	NC_015216	AT	3	6	6251	6256	50 %	50 %	0 %	0 %	325957767
118	NC_015216	ACA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957767
119	NC_015216	ATTC	2	8	6321	6328	25 %	50 %	0 %	25 %	325957767
120	NC_015216	AAATTA	2	12	6338	6349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957767
121	NC_015216	A	8	8	6380	6387	100 %	0 %	0 %	0 %	325957768
122	NC_015216	TGAA	2	8	6450	6457	50 %	25 %	25 %	0 %	325957768
123	NC_015216	AGA	2	6	6496	6501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
124	NC_015216	A	6	6	6524	6529	100 %	0 %	0 %	0 %	325957768
125	NC_015216	GAA	2	6	6560	6565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
126	NC_015216	GTT	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957768
127	NC_015216	GGAT	2	8	6646	6653	25 %	25 %	50 %	0 %	325957768
128	NC_015216	GTGA	2	8	6671	6678	25 %	25 %	50 %	0 %	325957768
129	NC_015216	AT	3	6	6709	6714	50 %	50 %	0 %	0 %	325957768
130	NC_015216	TGG	2	6	6732	6737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957768
131	NC_015216	GAA	2	6	6800	6805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
132	NC_015216	GAA	2	6	6821	6826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
133	NC_015216	AG	3	6	6832	6837	50 %	0 %	50 %	0 %	325957768
134	NC_015216	AAT	2	6	6862	6867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957768
135	NC_015216	CAC	2	6	6919	6924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957768
136	NC_015216	TCCAAT	2	12	6925	6936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957768
137	NC_015216	ATA	2	6	6953	6958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957768
138	NC_015216	T	6	6	7156	7161	0 %	100 %	0 %	0 %	325957768
139	NC_015216	A	6	6	7217	7222	100 %	0 %	0 %	0 %	325957768
140	NC_015216	GA	3	6	7258	7263	50 %	0 %	50 %	0 %	325957768
141	NC_015216	GAA	2	6	7268	7273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
142	NC_015216	GTT	2	6	7316	7321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957768
143	NC_015216	GTT	2	6	7352	7357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957768
144	NC_015216	AAC	2	6	7480	7485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957768
145	NC_015216	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957768
146	NC_015216	A	6	6	7563	7568	100 %	0 %	0 %	0 %	325957768
147	NC_015216	CCATAG	2	12	7611	7622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325957768
148	NC_015216	CTG	2	6	7646	7651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957768
149	NC_015216	GTT	2	6	7697	7702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957768
150	NC_015216	ACA	2	6	7823	7828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957768
151	NC_015216	GAA	2	6	8015	8020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
152	NC_015216	TGG	2	6	8032	8037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957768
153	NC_015216	ATC	2	6	8072	8077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957768
154	NC_015216	A	7	7	8103	8109	100 %	0 %	0 %	0 %	325957768
155	NC_015216	AT	3	6	8139	8144	50 %	50 %	0 %	0 %	325957768
156	NC_015216	GAT	2	6	8189	8194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957768
157	NC_015216	CAG	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957768
158	NC_015216	ATG	2	6	8445	8450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957768
159	NC_015216	GTG	2	6	8517	8522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957768
160	NC_015216	CAT	2	6	8545	8550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957768
161	NC_015216	A	6	6	8579	8584	100 %	0 %	0 %	0 %	325957768
162	NC_015216	GTG	2	6	8633	8638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957768
163	NC_015216	CCT	2	6	8771	8776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957768
164	NC_015216	GATG	2	8	8880	8887	25 %	25 %	50 %	0 %	325957769
165	NC_015216	A	6	6	8894	8899	100 %	0 %	0 %	0 %	325957769
166	NC_015216	A	6	6	8929	8934	100 %	0 %	0 %	0 %	325957769
167	NC_015216	A	7	7	8959	8965	100 %	0 %	0 %	0 %	325957769
168	NC_015216	GAA	2	6	8971	8976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957769
169	NC_015216	CTTC	2	8	9101	9108	0 %	50 %	0 %	50 %	325957770
170	NC_015216	ATT	2	6	9109	9114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957770
171	NC_015216	AAC	2	6	9137	9142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957770
172	NC_015216	CTG	2	6	9188	9193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957770
173	NC_015216	CATC	2	8	9293	9300	25 %	25 %	0 %	50 %	325957770
174	NC_015216	TTG	2	6	9303	9308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957770
175	NC_015216	CAC	2	6	9321	9326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957770
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177	NC_015216	TTG	2	6	9472	9477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957770
178	NC_015216	TGAT	2	8	9522	9529	25 %	50 %	25 %	0 %	325957770
179	NC_015216	AACA	2	8	9537	9544	75 %	0 %	0 %	25 %	325957770
180	NC_015216	TA	3	6	9582	9587	50 %	50 %	0 %	0 %	325957770
181	NC_015216	CTT	2	6	9686	9691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957770
182	NC_015216	TCG	2	6	9703	9708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957770
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184	NC_015216	CTTTC	2	10	9832	9841	0 %	60 %	0 %	40 %	325957770
185	NC_015216	CCAT	2	8	9852	9859	25 %	25 %	0 %	50 %	325957770
186	NC_015216	GTT	2	6	9887	9892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957770
187	NC_015216	CAT	2	6	9917	9922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957770
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230	NC_015216	ATT	2	6	12568	12573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957772
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232	NC_015216	T	6	6	12645	12650	0 %	100 %	0 %	0 %	325957772
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245	NC_015216	TTTG	2	8	13437	13444	0 %	75 %	25 %	0 %	325957773
246	NC_015216	T	7	7	13449	13455	0 %	100 %	0 %	0 %	325957773
247	NC_015216	CTT	2	6	13457	13462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957773
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250	NC_015216	TTC	2	6	13553	13558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957773
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252	NC_015216	ATC	2	6	13711	13716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957773
253	NC_015216	AAT	2	6	13748	13753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957773
254	NC_015216	AT	3	6	13781	13786	50 %	50 %	0 %	0 %	325957773
255	NC_015216	GT	4	8	13855	13862	0 %	50 %	50 %	0 %	325957773
256	NC_015216	CAT	2	6	13916	13921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957773
257	NC_015216	TCA	2	6	13954	13959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957773
258	NC_015216	T	7	7	13979	13985	0 %	100 %	0 %	0 %	325957773
259	NC_015216	T	6	6	14011	14016	0 %	100 %	0 %	0 %	325957773
260	NC_015216	T	6	6	14026	14031	0 %	100 %	0 %	0 %	325957773
261	NC_015216	CTG	2	6	14197	14202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957774
262	NC_015216	AGGAAT	2	12	14222	14233	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325957774
263	NC_015216	T	6	6	14257	14262	0 %	100 %	0 %	0 %	325957774
264	NC_015216	TTG	2	6	14323	14328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957774
265	NC_015216	GCA	2	6	14337	14342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957774
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267	NC_015216	AGA	2	6	14447	14452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957774
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